接種を受ける時期に供給されているワクチンを接種することになります。また、複数のワクチンが供給されている場合であっても、初回接種の2回目の接種では、原則として、1回目に接種したワクチンと同一のワクチンを接種する必要があります。なお、一定の要件を満たす場合に限り、1回目と異なるワクチンを2回目に接種すること（交互接種）は可能です。
従来ワクチン（1価）は令和4年（2022年）内に国からの供給を終了しており、モデルナ社の従来ワクチン（1価）による接種は令和5年（2023年）2月11日、ファイザー社の従来ワクチン（1価）による接種は同年9月19日をもって終了しました。また、モデルナ社のオミクロン株対応2価ワクチン（従来株／BA.1）による接種は令和5年6月14日、ファイザー社のオミクロン株対応2価ワクチン（従来株／BA.1又はBA.4-5）及びモデルナ社のオミクロン株対応2価ワクチン（従来株／BA.4-5）による接種は同年9月19日をもって終了しました。

なお、令和5年秋開始接種で使用するワクチンについてはこちら、初回接種で使用するワクチンについてはこちらをご覧ください。

（参考資料）
令和5年秋開始接種についてのお知らせ（リーフレット）
令和5年秋開始接種についてのお知らせ（厚生労働省HP）
初回接種（1回目・2回目接種）についてのお知らせ（厚生労働省HP）